Publikationen von Roman K. Thomas

Flümann, R.; Hansen, J.; Pelzer, B. W.; Nieper, P.; Lohmann, T.; Kisis, I.; Riet, T.; Kohlhas, V.; Nguyen, P.-H.; Peifer, M. et al.; Abedpour, N.; Bosco, G.; Thomas, R. K.; Kochanek, M.; Knüfer, J.; Jonigkeit, L.; Beleggia, F.; Holzem, A.; Büttner, R.; Lohneis, P.; Meinel, J.; Ortmann, M.; Persigehl, T.; Hallek, M.; Calado, D. P.; Chmielewski, M.; Klein, S.; Göthert, J. R.; Chapuy, B.; Zevnik, B.; Wunderlich, F. T.; von Tresckow, B.; Jachimowicz, R. D.; Melnick, A. M.; Reinhardt, H. C.; Knittel, G.: Distinct genetically determined origins of Myd88/BCL2-driven aggressive lymphoma rationalize targeted therapeutic intervention strategies. Blood Cancer Discovery 4 (1), S. 78 - 97 (2023)

Werr, L.; Plenker, D.; Dammert, M. A.; Lorenz, C.; Bragelmann, J.; Tumbrink, H. L.; Klein, S.; Schmitt, A.; Buttner, R.; Persigehl, T. et al.; Shokat, K. M.; Wunderlich, F. T.; Schram, A. M.; Peifer, M.; Sos, M. L.; Reinhardt, H. C.; Thomas, R. K.: CD74-NRG1 fusions are oncogenic in vivo and induce therapeutically tractable ERBB2:ERBB3 heterodimerization. Molecular Cancer Therapeutics 21 (5), S. 821 - 830 (2022)

Fernandez-Cuesta, L.; Sun, R.; Menon, R.; George, J.; Lorenz, S.; Meza-Zepeda, L. A.; Peifer, M.; Plenker, D.; Heuckmann, J. M.; Leenders, F. et al.; Zander, T.; Dahmen, I.; Koker, M.; Schöttle, J.; Ullrich, R. T.; Altmüller, J.; Becker, C.; Nürnberg, P.; Seidel, H.; Böhm, D.; Göke, F.; Ansen, S.; Russell, P. A.; Wright, G. M.; Wainer, Z.; Solomon, B.; Petersen, I.; Clement, J. H.; Sänger, J.; Brustugun, O. T.; Helland, A.; Solberg, S.; Lund-Iversen, M.; Büttner, R.; Wolf, J.; Brambilla, E.; Vingron, M.; Perner, S.; Haas, S. A.; Thomas, R. K.: Identification of novel fusion genes in lung cancer using breakpoint assembly of transcriptome sequencing data. Genome Biology 16, 7 (2015)

Peifer, M.; Hertwig, F.; Roels, F.; Dreidax, D.; Gartlgruber, M.; Menon, R.; Krämer, A.; Roncaioli, J. L.; Sand, F.; Heuckmann, J. M. et al.; Ikram, F.; Schmidt, R.; Ackermann, S.; Engesser, A.; Kahlert, Y.; Vogel, W.; Altmüller, J.; Nürnberg, P.; Thierry-Mieg, J.; Thierry-Mieg, D.; Mariappan, A.; Heynck, S.; Mariotti, E.; Henrich, K.-O.; Gloeckner, C.; Bosco, G.; Leuschner, I.; Schweiger, M. R.; Savelyeva, L.; Watkins, S. C.; Shao, C.; Bell, E.; Höfer, T.; Achter, V.; Lang, U.; Theissen, J.; Volland, R.; Saadati, M.; Eggert, A.; De Wilde, B.; Berthold, F.; Peng, Z.; Zhao, C.; Shi, L.; Ortmann, M.; Büttner, R.; Perner, S.; Hero, B.; Schramm, A.; Schulte, J. H.; Herrmann, C.; O'Sullivan, R. J.; Westermann, F.; Thomas, R. K.; Fischer, M.: Telomerase activation by genomic rearrangements in high-risk neuroblastoma. Nature 526 (7575), S. 700 - 704 (2015)

Fernandez-Cuesta, L.; Plenker, D.; Osada, H.; Sun, R.; Menon, R.; Leenders, F.; Ortiz-Cuaran, S.; Peifer, M.; Bos, M.; Daßler, J. et al.; Malchers, F.; Schöttle, J.; Vogel, W.; Dahmen, I.; Koker, M.; Ullrich, R. T.; Wright, G. M.; Russell, P. A.; Wainer, Z.; Solomon, B.; Brambilla, E.; Nagy-Mignotte, H.; Moro-Sibilot, D.; Brambilla, C. G.; Lantuejoul, S.; Altmüller, J.; Becker, C.; Nürnberg, P.; Heuckmann, J. M.; Stoelben, E.; Petersen, I.; Clement, J. H.; Sänger, J.; Muscarella, L. A.; la Torre, A.; Fazio, V. M.; Lahortiga, I.; Perera, T.; Ogata, S.; Parade, M.; Brehmer, D.; Vingrom, M.; Heukamp, L. C.; Buettner, R.; Zander, T.; Wolf, J.; Perner, S.; Ansen, S.; Haas, S. A.; Yatabe, Y.; Thomas, R. K.: CD74-NRG1 fusions in lung adenocarcinoma. Cancer Discovery 4 (4), S. 415 - 422 (2014)

Malchers, F.; Dietlein, F.; Schöttle, J.; Lu, X.; Nogova, L.; Albus, K.; Fernandez-Cuesta, L.; Heuckmann, J. M.; Gautschi, O.; Diebold, J. et al.; Plenker, D.; Gardizi, M.; Er, M. S.; Bos, M.; Seidel, D.; Leenders, F.; Richters, A.; Peifer, M.; Florin, A.; Mainkar, P. S.; Karre, N.; Chandrasekhar, S.; George, J.; Silling, S.; Rauh, D.; Zander, T.; Ullrich, R. T.; Reinhardt, H. C.; Ringeisen, F.; Buettner, R.; Heukamp, L. C.; Wolf, J.; Thomas, R. K.: Cell-autonomous and non-cell-autonomous mechanisms of transformation by amplified FGFR1 in lung cancer. Cancer Discovery 4 (2), S. 246 - 257 (2014)

Chatterjee, S.; Heukamp, L. C.; Siobal, M.; Schöttle, J.; Wieczorek, C.; Peifer, M.; Frasca, D.; Koker, M.; König, K.; Meder, L. et al.; Rauh, D.; Buettner, R.; Wolf, J.; Brekken, R. A.; Neumaier, B.; Christofori, G.; Thomas, R. K.; Ullrich, R. T.: Tumor vegf:vegfr2 autocrine feed-forward loop triggers angiogenesis in lung cancer. Journal of Clinical Investigation 123 (4), S. 1732 - 1740 (2013)

Seidel, D.; Zander, T.; Heukamp, L. C.; Peifer, M.; Bos, M.; Fernandez-Cuesta, L.; Leenders, F.; Lu, X.; Ansen, S.; Gardizi, M. et al.; Nguyen, C.; Berg, J.; Russell, P.; Wainer, Z.; Schildhaus, H.-U.; Rogers, T.-M.; Solomon, B.; Pao, W.; Carter, S. L.; Getz, G.; Hayes, D. N.; Wilkerson, M. D.; Thunnissen, E.; Travis, W. D.; Perner, S.; Wright, G.; Brambilla, E.; Buettner, R.; Wolf, J.; Thomas, R.; Gabler, F.; Wilkening, I.; Mueller, C.; Dahmen, I.; Menon, R.; Koenig, K.; Albus, K.; Merkelbach-Bruse, S.; Fassunke, J.; Schmitz, K.; Kuenstlinger, H.; Kleine, M.; Binot, E.; Querings, S.; Altmueller, J.; Boessmann, I.; Nuemberg, P.; Schneider, P.; Bogus, M.; Buettner, R.; Soltermann, A.; Moch, H.; Brustugun, O. T.; Solberg, S.; Lund-Iversen, M.; Helland, A.; Muley, T.; Hoffmann, H.; Schnabel, P. A.; Chen, Y.; Groen, H.; Timens, W.; Sietsma, H.; Clement, J. H.; Weder, W.; Saenger, J.; Stoelben, E.; Ludwig, C.; Engel-Riedel, W.; Smit, E.; Heideman, D. A. M.; Snijders, P. J. F.; Nogova, L.; Sos, M. L.; Mattonet, C.; Toepelt, K.; Scheffler, M.; Goekkurt, E.; Kappes, R.; Krueger, S.; Kambartel, K.; Behringer, D.; Schulte, W.; Galetke, W.; Randerath, W.; Heldwein, M.; Schlesinger, A.; Serke, M.; Hekmat, K.; Frank, K. F.; Schnell, R.; Reiser, M.; Huenerlituerkoglu, A.-N.; Schmitz, S.; Meffert, L.; Ko, Y.-D.; Litt-Lampe, M.; Gerigk, U.; Fricke, R.; Besse, B.; Brambilla, C.; Lantuejoul, S.; Lorimier, P.; Moro-Sibilot, D.; Cappuzzo, F.; Ligorio, C.; Damiani, S.; Field, J. K.; Hyde, R.; Validire, P.; Girard, P.; Muscarella, L. A.; Fazio, V. M.; Hallek, M.; Soria, J.-C.; Carter, S. L.; Achter, V.; Lang, U.: A genomics-based classification of human lung tumors. Science Translational Medicine 5 (209), 209ra153 (2013)

Chmielecki, J.; Peifer, M.; Viale, A.; Hutchinson, K.; Giltnane, J.; Socci, N. D.; Dean, R. S.; Yenamandra, A.; Jagasia, M.; Kim, A. S. et al.; Davé, U. P.; Thomas, R. K.; Pao, W.: Systematic screen for tyrosine kinase rearrangements identifies a novel C6orf204-PDGFRB fusion in a patient with recurrent T-ALL and an associated myeloproliferative neoplasm. Genes Chromosomes and Cancer 51 (1), S. 54 - 65 (2012)

Heuckmann, J. M.; Balke-Want, H.; Malchers, F.; Peifer, M.; Sos, M. L.; Koker, M.; Meder, L.; Lovly, C. M.; Heukamp, L. C.; Pao, W. et al.; Küppers, R.; Thomas, R. K.: Differential protein stability and ALK inhibitor sensitivity of EML4-ALK fusion variants. Clinical Cancer Research 18 (17), S. 4682 - 4690 (2012)

Höpker, K.; Hagmann, H.; Khurshid, S.; Chen, S.; Hasskamp, P.; Seeger-Nukpezah, T.; Schilberg, K.; Heukamp, L.; Lamkemeyer, T.; Sos, M. L. et al.; Thomas, R. K.; Lowery, D.; Roels, F.; Fischer, M.; Liebau, M. C.; Resch, U.; Kisner, T.; Röther, F.; Bartram, M. P.; Müller, R. U.; Fabretti, F.; Kurschat, P.; Schumacher, B.; Gaestel, M.; Medema, R. H.; Yaffe, M. B.; Schermer, B.; Reinhard, H. C.; Benzing, T.: AATF/Che-1 acts as a phosphorylation-dependent molecular modulator to repress p53-driven apoptosis. EMBO Journal 31 (20), S. 3961 - 3975 (2012)

Imielinski, M.; Berger, A. H.; Hammerman, P. S.; Hernandez, B.; Pugh, T. J.; Hodis, E.; Cho, J.; Suh, J.; Capelletti, M.; Sivachenko, A. et al.; Sougnez, C.; Auclair, D.; Lawrence, M. S.; Stojanov, P.; Cibulskis, K.; Choi, K.; De Waal, L.; Sharifnia, T.; Brooks, A.; Greulich, H.; Banerji, S.; Zander, T.; Seidel, D.; Leenders, F.; Ansén, S.; Ludwig, C.; Engel-Riedel, W.; Stoelben, E.; Wolf, J.; Goparju, C.; Thompson, K.; Winckler, W.; Kwiatkowski, D.; Johnson, B. E.; Jänne, P. A.; Miller, V. A.; Pao, W.; Travis, W. D.; Pass, H. I.; Gabriel, S. B.; Lander, E. S.; Thomas, R. K.; Garraway, L. A.; Getz, G.; Meyerson, M.: Mapping the hallmarks of lung adenocarcinoma with massively parallel sequencing. Cell 150 (6), S. 1107 - 1120 (2012)

Peifer, M.; Fernández-Cuesta, L.; Sos, M. L.; George, J.; Seidel, D.; Kasper, L. H.; Plenker, D.; Leenders, F.; Sun, R.; Zander, T. et al.; Menon, R.; Koker, M.; Dahmen, I.; Müller, C.; Di Cerbo, V.; Schildhaus, H.-U.; Altmüller, J.; Baessmann, I.; Becker, C.; de Wilde, B.; Vandesompele, J.; Böhm, D.; Ansén, S.; Gabler, F.; Wilkening, I.; Heynck, S.; Heuckmann, J. M.; Lu, X.; Carter, S. L.; Cibulskis, K.; Banerji, S.; Getz, G.; Park, K.-S.; Rauh, D.; Grütter, C.; Fischer, M.; Pasqualucci, L.; Wright, G.; Wainer, Z.; Russell, P.; Petersen, I.; Chen, Y.; Stoelben, E.; Ludwig, C.; Schnabel, P.; Hoffmann, H.; Muley, T.; Brockmann, M.; Engel-Riedel, W.; Muscarella, L. A.; Fazio, V. M.; Groen, H.; Timens, W.; Sietsma, H.; Thunnissen, E.; Smit, E.; Heideman, D. A. M.; Snijders, P. J. F.; Capuzzo, F.; Ligorio, C.; Damiani, S.; Field, J.; Solberg, S.; Brustugun, O. T.; Lund-Iversen, M.; Sänger, J.; Clement, J. H.; Soltermann, A.; Moch, H.; Weder, W.; Solomon, B.; Soria, J.-C.; Valldire, P.; Besse, B.; Brambilla, E.; Brambilla, C.; Lantuejoul, S.; Lorimier, P.; Schneider, P. M.; Hallek, M.; Pao, W.; Meyerson, M.; Sage, J.; Shendure, J.; Schneider, R.; Büttner, R.; Wolf, J.; Nürnberg, P.; Perner, S.; Heukamp, L. C.; Brindie, P. K.; Haas, S.; Thomas, R. K.: Integrative genome analyses identify key somatic driver mutations of small-cell lung cancer. Nature Genetics 44 (10), S. 1104- - 11xx (2012)

Perez-Moreno, P.; Brambilla, E.; Thomas, R. K.; Soria, J.-C.: Squamous cell carcinoma of the lung: molecular subtypes and therapeutic opportunities. Clinical Cancer Research 18 (9), S. 2443 - 2451 (2012)

Scheffler, M.; Kobe, C.; Zander, T.; Nogova, L.; Kahraman, D.; Thomas, R. K.; Neumaier, B.; Dietlein, M.; Wolf, J.: Monitoring reversible and irreversible EGFR inhibition with erlotinib and afatinib in a patient with EGFR-mutated non-small cell lung cancer (NSCLC) using sequential [ 18F]fluorothymidine (FLT-)PET. Lung Cancer 77 (3), S. 617 - 620 (2012)

Sos, M. L.; Dietlein, F.; Peifer, M.; Schöttle, J.; Balke-Want, H.; Müller, C.; Koker, M.; Richters, A.; Heynck, S.; Malchers, F. et al.; Heuckmann, J. M.; Seidel, D.; Eyers, P. A.; Ullrich, R. T.; Antonchik, A. P.; Vintonyak, V. V.; Schneider, P. M.; Ninomiya, T.; Waldmann, H. H.; Büttner, R.; Rauh, D.; Heukamp, L.; Thomas, R. K.: A framework for identification of actionable cancer genome dependencies in small cell lung cancer. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 109 (42), S. 17034 - 17039 (2012)

Sos, M. L.; Thomas, R. K.: Genetic insight and therapeutic targets in squamous-cell lung cancer. Oncogene 31 (46), S. 4811 - 4814 (2012)

The Cancer Genome Atlas Research Network, T. C. G. A. R. N.; Peifer, M.; Thomas, R. K.: Comprehensive genomic characterization of squamous cell lung cancers. Nature 489 (7417), S. 519 - 525 (2012)

Thomas, R. K.; Wolf, J.: Personalized therapy of lung cancer. Onkologie 35 (Suppl. 1), S. 14 - 19 (2012)

Chmielecki, J.; Foo, J.; Oxnard, G. R.; Hutchinson, K.; Ohashi, K.; Somwar, R.; Wang, L.; Amato, K. R.; Arcila, M.; Sos, M. L. et al.; Socci, N. D.; Viale, A.; de Stanchina, E.; Ginsberg, M. S.; Thomas, R. K.; Kris, M. G.; Inoue, A.; Ladanyi, M.; Miller, V. A.; Michor, F.; Pao, W.: Optimization of dosing for EGFR-mutant non-small cell lung cancer with evolutionary cancer modeling. Science Translational Medicine 3 (90), S. 90ra59 - 90ra59 (2011)