Publications of Mirjam Koker

Journal Article (15)

1.
Journal Article
Fernandez-Cuesta, L.; Sun, R.; Menon, R.; George, J.; Lorenz, S.; Meza-Zepeda, L. A.; Peifer, M.; Plenker, D.; Heuckmann, J. M.; Leenders, F. et al.; Zander, T.; Dahmen, I.; Koker, M.; Schöttle, J.; Ullrich, R. T.; Altmüller, J.; Becker, C.; Nürnberg, P.; Seidel, H.; Böhm, D.; Göke, F.; Ansen, S.; Russell, P. A.; Wright, G. M.; Wainer, Z.; Solomon, B.; Petersen, I.; Clement, J. H.; Sänger, J.; Brustugun, O. T.; Helland, A.; Solberg, S.; Lund-Iversen, M.; Büttner, R.; Wolf, J.; Brambilla, E.; Vingron, M.; Perner, S.; Haas, S. A.; Thomas, R. K.: Identification of novel fusion genes in lung cancer using breakpoint assembly of transcriptome sequencing data. Genome Biology 16, 7 (2015)
2.
Journal Article
Fernandez-Cuesta, L.; Plenker, D.; Osada, H.; Sun, R.; Menon, R.; Leenders, F.; Ortiz-Cuaran, S.; Peifer, M.; Bos, M.; Daßler, J. et al.; Malchers, F.; Schöttle, J.; Vogel, W.; Dahmen, I.; Koker, M.; Ullrich, R. T.; Wright, G. M.; Russell, P. A.; Wainer, Z.; Solomon, B.; Brambilla, E.; Nagy-Mignotte, H.; Moro-Sibilot, D.; Brambilla, C. G.; Lantuejoul, S.; Altmüller, J.; Becker, C.; Nürnberg, P.; Heuckmann, J. M.; Stoelben, E.; Petersen, I.; Clement, J. H.; Sänger, J.; Muscarella, L. A.; la Torre, A.; Fazio, V. M.; Lahortiga, I.; Perera, T.; Ogata, S.; Parade, M.; Brehmer, D.; Vingrom, M.; Heukamp, L. C.; Buettner, R.; Zander, T.; Wolf, J.; Perner, S.; Ansen, S.; Haas, S. A.; Yatabe, Y.; Thomas, R. K.: CD74-NRG1 fusions in lung adenocarcinoma. Cancer Discovery 4 (4), pp. 415 - 422 (2014)
3.
Journal Article
Chatterjee, S.; Heukamp, L. C.; Siobal, M.; Schöttle, J.; Wieczorek, C.; Peifer, M.; Frasca, D.; Koker, M.; König, K.; Meder, L. et al.; Rauh, D.; Buettner, R.; Wolf, J.; Brekken, R. A.; Neumaier, B.; Christofori, G.; Thomas, R. K.; Ullrich, R. T.: Tumor vegf:vegfr2 autocrine feed-forward loop triggers angiogenesis in lung cancer. Journal of Clinical Investigation 123 (4), pp. 1732 - 1740 (2013)
4.
Journal Article
Heuckmann, J. M.; Balke-Want, H.; Malchers, F.; Peifer, M.; Sos, M. L.; Koker, M.; Meder, L.; Lovly, C. M.; Heukamp, L. C.; Pao, W. et al.; Küppers, R.; Thomas, R. K.: Differential protein stability and ALK inhibitor sensitivity of EML4-ALK fusion variants. Clinical Cancer Research 18 (17), pp. 4682 - 4690 (2012)
5.
Journal Article
Peifer, M.; Fernández-Cuesta, L.; Sos, M. L.; George, J.; Seidel, D.; Kasper, L. H.; Plenker, D.; Leenders, F.; Sun, R.; Zander, T. et al.; Menon, R.; Koker, M.; Dahmen, I.; Müller, C.; Di Cerbo, V.; Schildhaus, H.-U.; Altmüller, J.; Baessmann, I.; Becker, C.; de Wilde, B.; Vandesompele, J.; Böhm, D.; Ansén, S.; Gabler, F.; Wilkening, I.; Heynck, S.; Heuckmann, J. M.; Lu, X.; Carter, S. L.; Cibulskis, K.; Banerji, S.; Getz, G.; Park, K.-S.; Rauh, D.; Grütter, C.; Fischer, M.; Pasqualucci, L.; Wright, G.; Wainer, Z.; Russell, P.; Petersen, I.; Chen, Y.; Stoelben, E.; Ludwig, C.; Schnabel, P.; Hoffmann, H.; Muley, T.; Brockmann, M.; Engel-Riedel, W.; Muscarella, L. A.; Fazio, V. M.; Groen, H.; Timens, W.; Sietsma, H.; Thunnissen, E.; Smit, E.; Heideman, D. A. M.; Snijders, P. J. F.; Capuzzo, F.; Ligorio, C.; Damiani, S.; Field, J.; Solberg, S.; Brustugun, O. T.; Lund-Iversen, M.; Sänger, J.; Clement, J. H.; Soltermann, A.; Moch, H.; Weder, W.; Solomon, B.; Soria, J.-C.; Valldire, P.; Besse, B.; Brambilla, E.; Brambilla, C.; Lantuejoul, S.; Lorimier, P.; Schneider, P. M.; Hallek, M.; Pao, W.; Meyerson, M.; Sage, J.; Shendure, J.; Schneider, R.; Büttner, R.; Wolf, J.; Nürnberg, P.; Perner, S.; Heukamp, L. C.; Brindie, P. K.; Haas, S.; Thomas, R. K.: Integrative genome analyses identify key somatic driver mutations of small-cell lung cancer. Nature Genetics 44 (10), pp. 1104- - 11xx (2012)
6.
Journal Article
Sos, M. L.; Dietlein, F.; Peifer, M.; Schöttle, J.; Balke-Want, H.; Müller, C.; Koker, M.; Richters, A.; Heynck, S.; Malchers, F. et al.; Heuckmann, J. M.; Seidel, D.; Eyers, P. A.; Ullrich, R. T.; Antonchik, A. P.; Vintonyak, V. V.; Schneider, P. M.; Ninomiya, T.; Waldmann, H. H.; Büttner, R.; Rauh, D.; Heukamp, L.; Thomas, R. K.: A framework for identification of actionable cancer genome dependencies in small cell lung cancer. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 109 (42), pp. 17034 - 17039 (2012)
7.
Journal Article
Hammerman, P. S.; Sos, M. L.; Ramos, A. H.; Xu, C.; Dutt, A.; Zhou, W.; Brace, L. E.; Woods, B. A.; Lin, W.; Zhang, J. et al.; Deng, X.; Lim, S. M.; Heynck, S.; Peifer, M.; Simard, J. R.; Lawrence, M. S.; Onofrio, R. C.; Salvesen, H. B.; Seidel, D.; Zander, T.; Heuckmann, J. M.; Soltermann, A.; Moch, H.; Koker, M.; Leenders, F.; Gabler, F.; Querings, S.; Ansen, S.; Brambilla, E.; Brambilla, C.; Lorimier, P.; Brustugun, O. T.; Helland, A.; Petersen, I.; Clement, J. H.; Groen, H.; Timens, W.; Sietsma, H.; Stoelben, E.; Wolf, J.; Beer, D. G.; Tsao, M. S.; Hanna, M.; Hatton, C.; Eck, M. J.; Janne, P. A.; Johnson, B. E.; Winckler, W.; Greulich, H.; Bass, A. J.; Cho, J.; Rauh, D.; Gray, N. S.; Wong, K.-K.; Haura, E. B.; Thomas, R. K.; Meyerson, M.: Mutations in the DDR2 kinase gene identify a novel therapeutic target in squamous cell lung cancer. Cancer Discovery 1 (1), pp. 78 - 89 (2011)
8.
Journal Article
Heuckmann, J. M.; Hölzel, M.; Sos, M. L.; Heynck, S.; Balke-Want, H.; Koker, M.; Peifer, M.; Weiss, J.; Lovly, C. M.; Grütter, C. et al.; Rauh, D.; Pao, W.; Thomas, R. K.: ALK mutations conferring differential resistance to structurally diverse ALK inhibitors. Clinical Cancer Research 17 (23), pp. 7394 - 7401 (2011)
9.
Journal Article
Peifer, M.; Weiss, J.; Sos, M. L.; Koker, M.; Heynck, S.; Netzer, C.; Fischer, S.; Rode, H.; Rauh, D.; Rahnenführer, J. et al.; Thomas, R. K.: Analysis of compound synergy in high-throughput cellular screens by population-based lifetime modeling. PLoS ONE 5 (1), p. e8919 - e8919 (2010)
10.
Journal Article
Sos, M. L.; Rode, H. B.; Heynck, S.; Peifer, M.; Fischer, F.; Klüter, S.; Pawar, V. G.; Reuter, C.; Heuckmann, J. M.; Weiss, J. et al.; Ruddigkeit, L.; Rabiller, M.; Koker, M.; Simard, J. R.; Getlik, M.; Yuza, Y.; Chen, T.-H.; Greulich, H.; Thomas, R. K.; Rauh, D.: Chemogenomic profiling provides insights into the limited activity of irreversible EGFR inhibitors in tumor cells expressing the T790M EGFR resistance mutation. Cancer Research 70 (3), pp. 868 - 874 (2010)
11.
Journal Article
Weiss, J.; Sos, M. L.; Seidel, D.; Peifer, M.; Zander, T.; Heuckmann, J. M.; Ullrich, R. T.; Menon, R.; Maier, S.; Soltermann, A. et al.; Moch, H.; Wagener, P.; Fischer, F.; Heynck, S.; Koker, M.; Schöttle, J.; Leenders, F.; Gabler, F.; Dabow, I.; Querings, S.; Heukamp, L. C.; Balke-Want, H.; Ansén, S.; Rauh, D.; Baessmann, I.; Altmüller, J.; Wainer, Z.; Conron, M.; Wright, G.; Russell, P.; Solomon, B.; Brambilla, E.; Brambilla, C.; Lorimier, P.; Sollberg, S.; Brustugun, O. T.; Engel-Riedel, W.; Ludwig, C.; Petersen, I.; Sänger, J.; Clement, J.; Groen, H.; Timens, W.; Sietsma, H.; Thunnissen, E.; Smit, E.; Heidemann, D.; Cappuzzo, F.; Ligorio, C.; Damiani, S.; Hallek, M.; Beroukhim, R.; Pao, W.; Klebl, B.; Baumann, M.; Buettner, R.; Ernestus, K.; Stoelben, E.; Wolf, J.; Nürnberg, P.; Perner, S.; Thomas, R. K.: Frequent and focal FGFR1 amplification associates with therapeutically tractable FGFR1 dependency in squamous cell lung cancer. Science Translational Medicine 2 (62), p. 62ra93 - 62ra93 (2010)
12.
Journal Article
Sos, M. L.; Fischer, S.; Ullrich, R.; Peifer, M.; Heuckmann, J. M.; Koker, M.; Heynck, S.; Stueckrath, I.; Weiss, J.; Fischer, F. et al.; Michel, K.; Goel, A.; Regales, L.; Politi, K. A.; Perera, S.; Getlik, M.; Heukamp, L. C.; Ansen, S.; Zander, T.; Beroukhim, R.; Kashkar, H.; Shokat, K. M.; Sellers, W. R.; Rauh, D.; Orr, C.; Hoeflich, K. P.; Friedman, L.; Wong, K.-K.; Pao, W.; Thomas, R. K.: Identifying genotype-dependent efficacy of single and combined PI3K- and MAPK-pathway inhibition in cancer. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 106, pp. 18351 - 18356 (2009)
13.
Journal Article
Sos, M. L.; Michel, K.; Zander, T.; Weiss, J.; Frommolt, P.; Peifer, M.; Li, D.; Ullrich, R.; Koker, M.; Fischer, F. et al.; Shimamura, T.; Rauh, D.; Mermel, C.; Fischer, S.; Stückrath, I.; Heynck, S.; Beroukhim, R.; Lin, W.; Winckler, W.; Shah, K.; LaFramboise, T.; Moriarty, W. F.; Hanna, M.; Tolosi, L.; Rahnenführer, J.; Verhaak, R.; Chiang, D.; Getz, G.; Hellmich, M.; Wolf, J.; Girard, L.; Peyton, M.; Weir, B. A.; Chen, T.-H.; Greulich, H.; Barretina, J.; Shapiro, G. I.; Garraway, L. A.; Gazdar, A. F.; Minna, J. D.; Meyerson, M.; Wong, K.-K.; Thomas, R. K.: Predicting drug susceptibility of non-small cell lung cancers based on genetic lesions. Journal of Clinical Investigation 119 (6), pp. 1727 - 1740 (2009)
14.
Journal Article
Sos, M.; Koker, M.; Weir, B.; Heynck, S.; Rabinovsky, R.; Zander, T.; Seeger, J. M.; Weiss, J.; Fischer, F.; Frommolt, P. et al.; Michel, K.; Peifer, M.; Mermel, C.; Girard, L.; Peyton, M.; Gazdar, A. F.; Minna, J. D.; Garraway, L. A.; Kashkar, H.; Pao, W.; Meyerson, M.; Thomas, R. K.: PTEN loss contributes to erlotinib resistance in EGFR-mutant lung cancer by activation of Akt and EGFR. Cancer Research 69 (8), pp. 3256 - 3261 (2009)
15.
Journal Article
Ullrich, R. T.; Zander, T.; Neumaier, B.; Koker, M.; Shimamura, T.; Waerzeggers, Y.; Borgman, C. L.; Tawadros, S.; Li, H.; Sos, M. L. et al.; Backes, H.; Shapiro, G. I.; Wolf, J.; Jacobs, A. H.; Thomas, R. K.; Winkeler, A.: Early detection of erlotinib treatment response in NSCLC by 3'-Deoxy-3'-[18F]-fluoro-L-thymidine ([18F]FLT) positron emission tomography (PET). PLoS ONE 3 (12), p. e3908 - e3908 (2008)
Go to Editor View